Postoje četiri načina za ulazak nanočestica u ljudsko tijelo: udisanje, gutanje, apsorpcija iz kože ili namjerno ubrizgavanje (ili oslobađanje od implantata) tijekom medicinskih postupaka. Jednom u ljudskom tijelu, imaju visok stupanj pokretljivosti. U nekim slučajevima, oni čak mogu prijeći krvno - moždanu barijeru.
Ponašanje nanočestica u organima još uvijek je velika tema koju treba proučavati. U osnovi, ponašanje nanočestica ovisi o njihovoj veličini, obliku i interakciji s okolnim tkivima. Oni mogu uzrokovati "preopterećenje" faga (stanica koje gutaju i uništavaju strane tvari), što može potaknuti obrambenu groznicu i smanjiti imunitet tijela. Mogu se akumulirati u organima jer se ne mogu sporo razgraditi ili razgraditi. Druga briga je potencijalna opasnost njihove reakcije s nekim biološkim procesima u ljudskom tijelu. Zbog velike površine, nanočestice izložene tkivima i tekućinama odmah će adsorbirati makromolekule s kojima se susreću. To će utjecati na, na primjer, mehanizam prilagodbe enzima i drugih proteina.