Proteomika se usredotočuje na dinamičan opis regulacije gena, kvantitativno određivanje proteinskih razina ekspresije gena, identifikaciju učinaka bolesti i lijekova na životne procese te objašnjenje mehanizma regulacije ekspresije gena. Kao znanost, proteomička istraživanja nisu od nule U početku, to je produžetak proteina (peptid) profila i tehnologije mapiranja genskih proizvoda koja se koristi više od 20 godina. Mapiranje peptida oslanja se na dvodimenzionalnu elektroforezu gela (2-DE) i daljnju analizu slike; i gen Profil proizvoda ovisi o različitim analizama nakon odvajanja, kao što su masena spektrometrija, analiza sastava aminokiselina itd.
Zbog postojanja varijabilnog uređivanja i uređivanja RNK, mnogi geni mogu izraziti različite proteine. Stoga je složenost proteoma mnogo veća od složenosti genoma.
Ako je cijeli slijed genoma vrste dešifriran, to ne znači da je proteom te vrste također dešifriran. Specifičnu analizu proteinskog proizvoda gena treba odrediti sveobuhvatnom izmjenom i regulacijom razine genoma, razine transkripcije i razine prijevoda.